摘要:目的 研究N6-甲基腺苷（m6A）修饰在中晚期头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）的作用和基因相关通路，为头颈部HNSCC患者的个体化精准治疗提出新的观点及研究参考。方法 选取3对临床中晚期HNSCC患者的癌及其癌旁组织（6个样本）进行测序，从癌和癌旁组织的转录组、m6A相关差异基因中筛选出两者共同的差异基因，通过基因本体（GO）分析、pathway分析及蛋白相互作用（PPI）分析，找出其中的枢纽（hub）基因，随后对网络中的基因进行基因集变异分析（GSVA），从而得到m6A修饰影响的基因及通路。结果 从癌与癌旁组织的差异基因中筛选出96个转录组m6A相关的上调基因、159个m6A相关下调基因；信号通路分析发现PPAR通路、免疫相关通路下调，代谢通路上调；构建PPI后发现，CDK1呈现上调趋势，而DCN及ARG2均呈现下调趋势；GSVA分析发现PI3K/AKT信号通路在癌组织中上调；PPI中的hub基因共表达分析发现AGR2和CDK1在m6A调控下，与铁死亡相关基因联系很密切。结论 m6A修饰与FOXA1、RPL8、DNC、CDK1、ApoE、POSTN、YWHAZ、MMP13等铁死亡相关基因紧密相关，m6A修饰可能通过铁死亡相关基因影响免疫、代谢相关通路，从而在中晚期HNSCC中起重要作用。

摘要:目的 探索N6-甲基腺苷(m6A)相关长链非编码核糖核酸(lncRNA)与喉鳞状细胞癌(LSCC)的预后关系及其临床意义。方法 获取癌症基因组图谱 (TCGA)数据库LSCC的转录组数据和临床数据，共表达分析筛选m6A基因相关的lncRNA，单变量Cox分析m6A相关lncRNA与LSCC预后关系、套索回归及交叉验证法迭代分析构建LSCC预后模型。采用实时荧光定量聚合酶链式反应 (qPCR) 验证构建预后模型的lncRNA在LSCC中的转录水平。通过预后模型计算风险评分，将LSCC区分为高、低风险患者，高、低风险患者之间进行基因集富集分析(GSEA)。风险评分与浸润LSCC的免疫细胞进行免疫相关性分析。结果 m6A相关基因与lncRNA的共表达分析筛选出169个与m6A基因相关的lncRNA(相关系数>0.4，P<0.001)，通过单变量Cox分析确定了LSCC预后相关lncRNA：ALOX12-AS1(P<0.05)、LINC00528(P<0.05)、STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB(P<0.05)、MNX1-AS1(P<0.01)和LINC02043(P<0.05)。套索回归、交叉验证迭代分析结果：变量为4时模型的均方根误差最小，即5个预后相关lncRNA仅有ALOX12-AS1、LINC00528、STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB与MNX1-AS1可作为模型变量。预后模型：风险评分=(0.176723096228585×MNX1-AS1表达量)+(-0.614916717648596×ALOX12-AS1表达量)+(-0.814201385798827×LINC00528表达量)+(-0.436537752110547×STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB表达量)。qPCR 结果ALOX12-AS1(P<0.0001)、LINC00528(P<0.01)、STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB(P<0.0001)、MNX1-AS1(P<0.0001)较于癌旁组织，在LSCC组织表达水平上调。GSEA分析结果：高风险患者在细胞-基质粘附(KEGG_FOCAL_ADHESION)(P<0.05)与细胞外基质受体相互作用(KEGG_ECM_RECEPTOR_INTERACTION)(P<0.05)的通路下调，低风险患者在碱基切除修复(KEGG_SPLICEOSOME)(P<0.05)、剪接体(KEGG_SPLICEOSOME)(P<0.05)通路上调。风险评分与免疫浸润细胞相关性分析，风险评分与效应B细胞(R=-0.24,P=0.017)、细胞毒性T细胞(R=-0.26,P=0.0091)和T滤泡辅助细胞(R=-0.22,P=0.028)呈负相关。结论 基于m6A相关LncRNA表达量构建的LSCC预后模型可作为预测LSCC患者预后的有效工具。